在统筹城乡就业的改革过程中，对于劳动力在就业时面临的公共就业服务、社保医保等多方面的综合配套制度改革也同时进行。我国公共就业服务虽然起步晚，发展相对滞后，但是自统筹就业改革开展后，地方政府积极制定、完善职业培训等政策，为全员培训提供保障，特别是农民的技能培训，从而全面提高城乡劳动力素质。例如，江苏以“培训券”为依托，实行农民自主选择参加特定类别培训的服务保障制度，实现扶持政策与整合资源并行，提高了培训和公共服务的质量。
我国社会保障制度的改革在近10年来也在不断推进中。随着我国政府对城乡劳动力整合工作的不断推进，三大经济区域已普遍实现了将外来流动劳动力纳入本地城镇劳动力的社会保险体系，并且各地区对社会保障制度也有不同程度的改进。北京和浙江还对医疗保险等制度进行了改进和完善，成为我国最早实现对外来务工的社会保障的省市之一。虽然保险的转接性仍是一大问题，但是其在一定程度上也为流动劳动力提供了保障，农民工参保率也因此得到提高。